En la década pasada, estudios direccionados de los mecanismos entendimiento de bacterias de degradadora de hidrocarburos tienen primariamente enfocada sobre las enzimas involucradas en el paso inicial la oxidación de hidrocarburos, particularmente hidrocarburos de cadena corta y media (11,12,13,14).
Los mecanismos de degradación asociados con los hidrocarburos de cadena larga y ramificados son menos entendidos. Quorum sensing de bacterias, transducción de señales, mecanismos quimiotácticos y de absorción involucradas y como degradación de hidrocarburos es regulado por restos virtualmente desconocidos por todos los hidrocarburos.
Las Especies Alcanivorax son las más importantes bacterias degradadoras de hidrocarburos en ambientes marinos. En agregado a A. borkumensis, A. dieselolei son otras bacterias estudiadas intensivamente en este género. La bacteria A. dieselolei puede ser encontrada en ambas regiones costeras y pelágicas, desde la superficie del río a profundidades del océano y desde áreas tropicales a polares. Como el tipo de cadena de A. dieselolei la cepa B5 degrada activamente numerosos hidrocarburos , incluyendo hidrocarburos ramificados. Lo producido recientemente como lipopeptido es un biosurfactante que acelera el consumo de aceite. Esta bacteria codifica un complejo sistema monooxygenasa que incluye tres membranas no hemo del grupo hierro una hidroxilasas, una proteína citocromo P450 y una monooxigenasa unión a flavina putativa (AlmA) . AlmA es postulada para ser responsable para la degradación de hidrocarburos de cadena larga.
A pesar de la rutas de utilización de hidrocarburos múltiple puede coexistir en una simple bacteria, como ellas son coordinadas es poco clara. Varios activadores transcripcionales han sido identificados en especies Acinetobacter, Alcanivorax y Pseudomonas. Estos activadores son típicamente codificados por una red de genes relacionados con una monooxigenasa, pero su regulación ha sido raramente investigada. En Pseudomonas aeruginosa, dos genes alk son diferencialmente expresados en respuesta a los hidrocarburos C10-C22, pero el mecanismo subyacente de esta expresión diferencial es desconocido. En P. putida, genes AlkB tal vez controlados por proteína regulatoria global Crc. Sin embargo, el gen crc es ausente desde los genes de A. dieselolei B5 y A. borkumensis SK2.
El mecanismo que controla la respuesta temprana de bacterias para hidrocarburos, tal como quórum sensing de hidrocarburos; quimiotaxis y consumo de los mismos. A pesar de que quimiotaxis de hidrocarburos ha sido observado en bacterias aisladas de Flavimonas oryzihabitans y P. aeruginosa PAO1, la maquinaria subsecuente no ha sido identificada. En agregado, el consumo de hidrocarburos es un paso esencial antes de la utilización, pero el mecanismo por cómo se consume es también desconocido. Este ha sido propuesto que el consumo directo de hidrocarburos soluble es facilitado por surfactantes. Por hidrocarburos aromáticos, ciertos factores que permiten el transporte alrededor de la membrana externa han sido identificados.
A Partir de la ruta de oxidación terminal iniciada por las enzimas hidrolasas AlkB y citocromo P450, la mayoría de la redes remanentes indeterminadas, incluyen quorum sensing de hidrocarburos, quimiotaxis, regulación diferencial de transporte transmembrana. Para entender la respuesta temprana que ocurre en presencia de hidrocarburos, hemos creado una biblioteca de genoma mutante azaroso de A dieselolei B5. Usando la biblioteca mutante, visualizamos e identificamos genes en bacterias mutantes con crecimiento anormal en presencia de diferentes hidrocarburos. Fomentamos roles determinados de genes mutados en quorum sensing de hidrocarburos; quimiotaxis y consumo de los mismos, y regulación, coordinación de rutas de utilización de diferentes hidrocarburos.
F: Masscience. Scielo.
